Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CCDC6Q16204 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC6Q16204 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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