Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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