Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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