Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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NFIXQ14938 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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NFIXQ14938 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIXQ14938 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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