Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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