Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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