Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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