Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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