Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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