Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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