Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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