Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms