Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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