Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3FQ13275 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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