Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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