Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CNTN1Q12860 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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CNTN1Q12860 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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CNTN1Q12860 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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