| CNTN1 | Q12860 | AC078809.1-201 | ENST00000427601 | 140 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL133396.1-201 | ENST00000432048 | 687 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL591806.2-201 | ENST00000433122 | 173 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC009238.1-201 | ENST00000442165 | 424 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC016700.2-201 | ENST00000446011 | 156 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC009237.6-201 | ENST00000446969 | 424 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | FGF7P6-202 | ENST00000451282 | 293 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPS29P27-201 | ENST00000463711 | 170 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL9P9-202 | ENST00000466501 | 579 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC117394.2-201 | ENST00000487827 | 323 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC018868.1-201 | ENST00000491307 | 315 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC015911.1-201 | ENST00000495111 | 156 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC096733.1-201 | ENST00000503844 | 402 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LINC02061-201 | ENST00000514225 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA31.16-201 | ENST00000516773 | 139 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC124290.1-202 | ENST00000523342 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC023906.2-201 | ENST00000558343 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA59B-202 | ENST00000578183 | 701 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR4524B-201 | ENST00000581569 | 115 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZNF667-AS1-209 | ENST00000601875 | 495 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC018889.1-201 | ENST00000605372 | 397 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORD14A-201 | ENST00000606526 | 91 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | U6atac.1-201 | ENST00000616025 | 117 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC006504.8-201 | ENST00000621046 | 635 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL356292.1-201 | ENST00000283110 | 373 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA25B-201 | ENST00000365507 | 128 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BTLA-202 | ENST00000383680 | 726 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA26.3-201 | ENST00000391119 | 136 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6ATAC38P-201 | ENST00000408119 | 126 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RN7SKP158-201 | ENST00000410453 | 326 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-325P-201 | ENST00000411132 | 105 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL030996.1-201 | ENST00000411430 | 235 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HMGB3P2-201 | ENST00000411913 | 584 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | USP9YP28-201 | ENST00000435142 | 589 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | IFNA11P-201 | ENST00000446352 | 526 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL354949.1-201 | ENST00000446438 | 170 nt | TSL 2 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | NFU1P2-201 | ENST00000448700 | 469 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZEB1-AS1-204 | ENST00000450834 | 576 nt | TSL 3 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | U8.21-201 | ENST00000459536 | 136 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC069439.1-201 | ENST00000494739 | 167 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC016632.1-201 | ENST00000503994 | 196 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LINC02064-201 | ENST00000506492 | 470 nt | TSL 5 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-256P-201 | ENST00000516747 | 97 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC009127.3-201 | ENST00000570531 | 403 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR3136-201 | ENST00000583498 | 78 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR5002-201 | ENST00000584713 | 97 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | FSIP2-206 | ENST00000611759 | 3882 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL138726.1-201 | ENST00000614873 | 333 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC245884.12-201 | ENST00000615364 | 59 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC063943.3-201 | ENST00000615562 | 356 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA43.4-201 | ENST00000629559 | 138 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SEMG1-201 | ENST00000372781 | 1662 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC092268.1-201 | ENST00000342691 | 405 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU4-15P-201 | ENST00000362613 | 141 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-227P-201 | ENST00000362865 | 103 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | Y_RNA.504-201 | ENST00000384481 | 104 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BTF3L4P2-201 | ENST00000392798 | 346 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | U3.40-201 | ENST00000408706 | 208 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC027124.2-201 | ENST00000428249 | 105 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTND3P9-201 | ENST00000429526 | 346 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | snoU13.23-201 | ENST00000458863 | 104 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090255.1-201 | ENST00000495779 | 349 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTCO1P29-201 | ENST00000496868 | 288 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC012312.1-201 | ENST00000503710 | 527 nt | TSL 2 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC116337.1-201 | ENST00000509680 | 687 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU1-40P-201 | ENST00000516816 | 164 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU1-97P-201 | ENST00000516872 | 164 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RBBP8-210 | ENST00000581687 | 617 nt | TSL 2 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DLGAP1-AS4-201 | ENST00000582054 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR3672-201 | ENST00000584290 | 82 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR3942-201 | ENST00000585264 | 109 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC078795.3-201 | ENST00000602913 | 472 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL136221.1-201 | ENST00000621449 | 509 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL450472.1-202 | ENST00000637286 | 180 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTND4P5-201 | ENST00000435821 | 1374 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | Y_RNA.135-201 | ENST00000363439 | 95 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-142P-201 | ENST00000384019 | 107 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA51.11-201 | ENST00000384442 | 131 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | Y_RNA.597-201 | ENST00000410463 | 100 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MRLN-201 | ENST00000414264 | 422 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HMGN2P38-201 | ENST00000423806 | 265 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL590632.1-201 | ENST00000424289 | 371 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL445259.1-203 | ENST00000427828 | 251 nt | TSL 3 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | WARS2P1-201 | ENST00000429678 | 537 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL591501.1-201 | ENST00000439992 | 495 nt | TSL 5 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | IPO7P1-201 | ENST00000442031 | 636 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU7-187P-201 | ENST00000458985 | 68 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC096745.1-201 | ENST00000509945 | 370 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007375.1-201 | ENST00000554513 | 578 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC005909.1-201 | ENST00000577835 | 755 nt | TSL 3 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CPDP1-201 | ENST00000579660 | 283 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP005057.1-201 | ENST00000583827 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |