Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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BPTFQ12830 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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