Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRCP08575 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRCP08575 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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