Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS6KC1Q96S38 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPS6KC1Q96S38 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms