Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TMIEQ8NEW7 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TMIEQ8NEW7 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms