Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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KNOP1Q1ED39 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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KNOP1Q1ED39 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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KNOP1Q1ED39 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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