Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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