Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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