Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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SGCAQ16586 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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