Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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