Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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