Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK4Q16099 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms