Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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