Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USF2Q15853 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USF2Q15853 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USF2Q15853 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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