Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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VAMP3Q15836 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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VAMP3Q15836 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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VAMP3Q15836 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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