Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNHIT3Q15649 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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