Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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