Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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NECTIN1Q15223 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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NECTIN1Q15223 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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NECTIN1Q15223 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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