Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAM2Q15035 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms