Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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