Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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