Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms