Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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