Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms