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| RUNX3 | Q13761 | SNORA40.18-201 | ENST00000391200 | 128 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133475.1-201 | ENST00000404414 | 305 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR548F5-201 | ENST00000408421 | 86 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-858P-201 | ENST00000362436 | 107 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC009314.1-201 | ENST00000603871 | 304 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRKACB-204 | ENST00000370685 | 4481 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-562P-201 | ENST00000362731 | 107 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-17P-201 | ENST00000363022 | 152 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TSACC-205 | ENST00000368255 | 751 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SET-203 | ENST00000372688 | 801 nt | TSL 2 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1009P-201 | ENST00000390996 | 107 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU2-41P-201 | ENST00000410991 | 178 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074117.2-201 | ENST00000417130 | 397 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445685.2-201 | ENST00000422551 | 342 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | DEFB130B-201 | ENST00000437818 | 240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP16-201 | ENST00000440828 | 295 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC109479.2-201 | ENST00000517842 | 174 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGHVIII-5-1-201 | ENST00000523059 | 99 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL133279.1-202 | ENST00000556789 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS3AP23-202 | ENST00000574601 | 686 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4790-201 | ENST00000577799 | 79 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100830.2-201 | ENST00000581636 | 240 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POLR3GP2-201 | ENST00000588366 | 668 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02112-205 | ENST00000606744 | 236 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022017.1-201 | ENST00000608793 | 559 nt | TSL 4 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244517.12-201 | ENST00000623581 | 663 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLITRK6-201 | ENST00000400286 | 4318 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC111000.4-202 | ENST00000505646 | 2648 nt | TSL 2 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.151-201 | ENST00000363566 | 112 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.263-201 | ENST00000364659 | 114 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-128P-201 | ENST00000383976 | 107 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.473-201 | ENST00000384333 | 102 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-306P-201 | ENST00000384617 | 107 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR524-201 | ENST00000385242 | 87 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |