Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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