Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms