Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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