Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms