Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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