Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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