Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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