Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX10Q13206 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DDX10Q13206 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX10Q13206 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX10Q13206 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms