Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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CHAF1BQ13112 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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CHAF1BQ13112 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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CHAF1BQ13112 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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