Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PRDM2Q13029 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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