Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms